钱柜游戏网址知识库

登录钱柜游戏网址

“临床+基因”才是医学大数据风向标,助力医院掘金大数据资产、深挖数据的他们为什么备受青睐?

周梦亚 2018-11-20 08:00

2018年的11月,对生命奇点而言是忙碌却又充满喜悦的丰收之月。他们成功中标了江苏省肿瘤医院肿瘤精准医学大数据平台项目,用其自主研发的国内第一款精准医学大数据产品VitArk打造基于大数据的智慧医院。


11月19日,公司联合武汉大学中南医院成功举办了一场高水平的“医疗大数据和临床研究”学术研讨会,生命奇点首席科学官佟崴嵬博士在会上分享了和医院合作的即将发表在国际顶级学术杂志的临床研究成果。


食欲.jpeg

生命奇点首席顾问石瑜教授


藏.jpeg

生命奇点首席顾问张泽民


这一系列事件,似乎反映了大数据行业的重要变革:大型医疗结构一直以来都是大数据行业的重要“玩家”,他们都已经纷纷开始行动,与专业医疗大数据公司携手掘金医疗大数据宝藏,尤其是临床表型数据加上基因组数据的整合利用,似乎成为了一个新的行业热点。


而就在此前,西北地区最大的生物样本信息资源中心在西安交大第一附属医院正式建成。按照整体规划,这里将被建设成为一个整合生物样本、临床电子病历、生物组学等各种信息资源为一体的新一代大规模生物医学信息中心。


毫无疑问,该资源中心将是支撑精准医学研究和转化的生物医学大数据资源宝藏。中心的建立与管理,需要信息管理系统、以及生物医学数据资源整合和分析系统的支持,而这背后的技术支持,正式来自生命奇点的BioBank 3.0解决方案。


生命奇点成立于2015年,是国内为数不多的聚焦于精准医学大数据技术的高科技企业。除了西安交大一附院外,生命奇点还基于核心产品精准医学大数据产品VitArk 与天津肿瘤医院等超过200家三甲医院签署了合作。


BioBank 3.0:数据和科研资料管理的新模式


BioBank 3.0是生命奇点基于自主知识产权的精准医学大数据产品VitArk提出的实验室数据管理整体解决方案。在这之前,以往的生物样本管理系统往往仅局限在对生物样本收集和管理的关注。比如科室级分散的生物样本管理的BioBank1.0和全院级的生物样本管理的BioBank2.0。


市场上前两个阶段的产品重点都是生物样本的存储管理,而BioBank3.0则不仅关注是生物标本的管理,而是为医疗机构打造生物样本、临床数据、基因信息三位一体的整合型科研资源平台,并帮助医疗机构进行生物医学信息资源的分析和挖掘。 


BioBank3.0突破性的覆盖了样本管理、数据连接、分析和挖掘等综合大数据管理。除了实现表型和组学数据的挖掘和共享、建立样本信息和临床信息的连接,该系统还能为实验室和中心建立生物样本库,构建配套的生物组学中心。


简单来说,BioBank3.0是一个精准医学大数据平台。与EDC这样的临床研究数据采集系统相比,BioBank3.0是一个精准医学大数据平台,可以整合生物标本信息、临床电子病历和随访、生物信息,核心是多组学数据的治理和分析。


把生物标本、组学、信息化数据一体化管理结合起来,生命奇点为国内数据资源和科研资源管理提供了一种新模式。


临床和基因整合是精准医疗大趋势


类似BioBank 3.0的新一代生物医学信息大数据资源平台是医疗行业的一个发展趋势。从美国的精准医学计划和英国的UK BioBank,都是这种模式的实践落地。中国具有更大规模更多样性的生物标本资源和临床大数据资源,未来存在快速发展的机会。


事实上,随着近年来精准医学和医疗大数据的发展,传统的着眼于管理生物标本储存的生物样本库已经远远不能满足临床科研和转化的需求。从美国的精准医学计划、中国的精准医学重点研发计划,以及英国的UK Biobank,都是立足于建立整合生物标本、临床数据、基因信息等各种资源的生物医学大数据平台。


“临床科研的难点之一在于高质量科研数据的资源匮乏。”刘立宇告诉钱柜游戏网址。


临床科研所需要的不仅仅是电子病历等临床数据,分子生物学在临床上发挥的价值越来越大。临床数据和基因大数据的整合才是真正意义的医疗大数据。基于大数据真实世界研究和分子生物学支撑的精准医学是未来临床研究和转化的重要方向,而这两者都依赖于精准医学大数据。


“医院的数据资源很多,但并不一定可以直接用于高质量的临床研究。”他补充道。只有经过系统整合和治理,实现数据的完整性和连续性,才有可能真正产生有价值的研究和转化成果。


罗氏、再生元入局,独角兽诞生,整合型数据成为国际趋势


不仅仅是国内,表型与生物组学数据的整合正在成为医疗大数据的全球趋势。


2016年,美国再生元公司与盖辛格医疗集团合作,打造了类似的整合生物样本、临床数据、基因信息的生物医学大数据平台,曾经利用110多万人连续14年的临床电子病历资料、5万人的基因组学数据,产生了很多对临床有意义的重大发现,相关成果发表在Science和新英格杂志,其中包括一个冠心病的靶点ANGPTL4基因突变。


亿万富翁Eric Lefkofsky 和Groupon公司共同创立的Tempus与生命奇点所做的事情颇为类似。Tempus希望通过临床和分子检测数据的整合来改善癌症治疗。公司从全国各地的医院收集分子检测数据和临床数据,并在一个数据库中对两者进行分析,目的是提高癌症患者的治疗水平。


短短3年的时间,Tempus已经建立起了业内最全面的数据库,并拥有一批临床合作伙伴作为业务的支持者。Tempus的平台采用了先进的机器学习技术、二代测序技术以及人工智能辅助的图像识别技术,在这些技术的加持下,医生能够拥有更强大的洞察力,对疾病有更深的认知。


到目前为止,Tempus以及与250家医院继续了系统合作,并收集了200万份临床病例。Tempus成立之初便获得了3.2亿美元的启动资金,在2018年的11月,这家公司先后完成了3轮融资,目前估值已经达到独角兽级别。


2018年2月,罗氏宣布将以19亿美元收购纽约的健康公司Flatiron Health,后者是一家医疗大数据公司。Flatiron Health的数据主要来自临床,他们与超过265家社区诊所和800多个学术机构建立了合作关系。


Flatiron Health主要是系统化的收集全美国的肿瘤医疗中心和其他医疗机构中的癌症临床数据,并建立肿瘤数据分析模型。如果这家公司代表了罗氏在临床数据的布局,那么Foundation Medicine的加入则为罗氏补充了分子诊断数据。


就在宣布收购Flatiron Health的4个月后,罗氏再次公布了一起收购大案——将以约24亿美元完成对Foundation Medicine的收购。


Foundation Medicine是一家在癌症诊疗领域处于领先的公司,致力于通过深度了解每名癌症患者体内的遗传变异,为医生们找到高度适合患者的创新治疗方案。这是罗氏继收购Flatiron后,在短短半年内完成的又一项大手笔收购。不少业内专家指出,这些收购将进一步扩大罗氏在癌症精准医学中的布局。


一手临床数据、一手分子诊断,罗氏通过对两个公司的收购补齐了自己在临床和分子诊断数据的布局。为此,罗氏总计花费了43亿美金!


“罗氏不仅收购了两家公司,更重要的是在医疗大数据如何帮助助力药物研发和推广提供了诸多生动具体的案例,给行业做了很多非常有价值的探索和实践。”刘立宇表示,“这是行业的一个重要事件,是医疗大数据发展的一个风向标。”


合作:西安交大、天津肿瘤医院......


类似西安交大附属第一医院生物样本信息资源中心这种全院级的一体化平台,在国内尚属非常少见的案例。但除了这家医院,生命奇点合作的案例还非常多。截至到目前,生命奇点参与治理和分析的数据覆盖超过7000万病人,积累了丰富的数据治理和分析经验,同时,生命奇点的精准医学大数据平台还支撑了几个高水平的大型专科研究网络。


天津肿瘤医院是其最早的合作标杆,也是一个肿瘤样本的BioBank 3.0的标杆。双方在2016年共同成立了国内第一家精准医学大数据中心。历时两年多,该中心建成了一个整合100多万肿瘤病人临床和随访信息、近10万例肿瘤组织标本信息、近千例全外显子信息的多组学生物医学大数据资源平台,并且已经产生高水平的学术研究成果。


基于共同建设的精准医学大数据平台,生命奇点与天津肿瘤将于近期在国际顶级的杂志发表研究论文。这是国内真正落地的高水平真实世界临床研究,非常考验数据治理能力和数据分析能力,生命奇点将是该论文共同通讯作者。


“这可能是国内医疗大数据赛道公司参与的迄今水平最高的真实世界研究成果,我们这次又深度参与其中,作为共同通讯作者署名,并且研究成果能够为临床医生和病人带来真正价值。”刘立宇向钱柜游戏网址透露。作为论文的共同通讯作者,这其中的参与并不只是简单的数据准备工作。


除了上述的科研成果。生命奇点自己也在过程中已经发现潜在的生物标记物,后续会做相关的临床转化。他们为合作医院构建了高质量的数据矿藏,并且持续帮助医院提升医疗数据的质量和生物样本的质量。


生物医学大数据的时代


西安交大附属第一医院生物样本信息资源中心主任王亚文认为:“当今是生物医学大数据的时代。”生物要本信息资源平台是医院临床研究转化的重要战略基础设施,他们将把平台打造成一个集生物样本、临床表型、生物组学为一体的临床研究和转化服务平台,为临床探索和转化真正起到支撑和推动作用,最终服务于临床患者。


“这也是一个合作共赢的时代,我们希望和学术研究机构丶专业的生物医学大数据产业机构一并合作,共同努力,切实的为医学研究和转化做出成果。”他补充道。


中国医药生物技术协会组织生物样本库分会委员叶扬博士曾经在英国UK BioBank就职,他认为:“国生物样本库经历了多年发展,现在必须和临床信息资源丶生物组学数据资源紧密结合,向整合型的生物医学大数据资源库转型,才能让生物样本库发挥真正的价值,这是样本库协会这几年在大力推动的一个方向。”


刘立宇相信,随着中国越来越多大型医疗机构对新型生物医疗信息资源平台的建设,以及像生命奇点这种技术公司的持续技术积累,相信中国也将出现能够持续产出研究和转化成果的高质量大规模的生物医学大数据资源平台。


他认为,精准医疗大数据未来是下一代数据能源产业,并将为我国的创新药械研发、临床诊疗方法开发提供巨大的推动力。


“希望我们在这个产业可以贡献自己的一点力量。”他补充道。


注:文中如果涉及钱柜游戏网址记者采访的数据,均由受访者提供并确认。如果您有资源对接,联系报道项目,寻求合作等需求请填写 需求表

声明:钱柜游戏网址所刊载内容之知识产权为钱柜游戏网址及相关权利人专属所有或持有。转载请联系tg@qdjunhai.com。

还没有评论,快来抢沙发吧!

分享

微信扫描二维码分享文章